En Alta Verapaz, hay un aproximado de 3,479 km2 de coníferas de bosque, que equivalen al 40% del territorio de este departamento.
El pino (Pinus caribaea y P. tenuifolia) es la especie dominante en el bosque de coníferas. El pino caribaea se encuentra distribuido en los municipios de Lanquín y Cahabón, mientras que el pinus tenuifolia se encuentra en las partes del departamento cuyas alturas sobrepasan los 1,200 msnm, especialmente en Cobán y San Pedro Carchá.
También se pueden encontrar especies de flora como: roble o encino, corozo, machinche, ramón blanco, nogal de montaña, zopotillo, chunup, aguacatillo, chute, madre cacao, paterna, cedro, teca, palo de sangre, guarumo, ceiba, ciprés común, liquidámbar, conacaste y caoba.
La fauna de Alta Verapaz también es diversa. Entre sus especies silvestres podemos mencionar: cotorra, loro, iguana, tepezcuintle, gavilán, tigrillo, jaguar, codorniz, cojolita, faisán, venado, mazacuata, cantil, jabalí y quetzal.
